שיטת הניקוי הכימי חלה על הכתמים הרציניים יחסית בתוך התרסיס, אותם ניתן לנקות עם ריאגנטים כימיים כמו חומץ ואבקת הלבנה. שיטת הפעולה היא כדלקמן:
1. הסר את הזרבובית וצינור הריסוס;
2. שופכים כמות מסוימת של חומץ או אבקת אקונומיקה למיכל המים והוסיפו כמות מסוימת של מים;
3. השרים את הזרבובית ואת צינור הריסוס בתמיסת הניקוי;
4. שיניים את פיתרון הניקוי באופן שווה ותן לו לעמוד כ- 30 דקות;
5. שופכים את תמיסת הניקוי ונקה את התרסיס במים נקיים.
